如果销售已经完成，但是客户对于产品的质量或者别的方面存在异议，双方协商以折扣和折让的方式处理。在系统中可以有如下3种处理方案：
第一：用贷项凭证的形式来处理折扣和折让。贷项凭证在系统中和发票一样，是一种不同类型的开票凭证。贷项凭证可以参照发票或者贷项凭证申请来创建，而且既可以针对整张发票也可以针对部分行项目，还可以针对行项目中的部分数量。使用贷项凭证申请，我们可以走正规的客户投诉和扣款流程，保证完善的内部控制。
如果我们不准备对实物发票，特别是增值税发票做任何处理，那么通过配置，可以让系统自动生成如下会计分录：借：产品销售折扣和折让 贷：应收帐款-客户明细。
对于这种处理方法需要注意如下两点：第一，贷项凭证没有增值税发票作为原始凭证，因此在我国是不能减少增值税销项额的，因此折扣应该给不含税价，否则折扣中的增值税部分就只能由销售方作为费用多承担了。但是在实际业务中这往往会使双方的业务人员夹缠不清，无法理解。第二，正由于贷项凭证没有发票做原始凭证，在我国的实施中可能会引起企业所得税上的麻烦。
但这种方案的优点是明显的：它不涉及对原增值税发票的处理，而众所周知，这类处理在我国是非常难的。
第二：用取消发票并重开来解决折扣和折让的问题。
取消发票在系统中会生成反方向的红字发票和冲销会计分录，业务人员取消原发票后重新开票，并更改价格条款。从实物发票的角度，会有如下两种情况：
1 如果对方能够返还两联增值税发票, 我们可以开出红字发票，其中记帐联作为减少销项税的原始凭证。其他三联和返还的原发票的两联应妥善保管。
2 如果对方不能返还两联中的任何一联，必须做如下操作：客户应从当地税务部门取得退货或折扣证明单并交给销售方。销售方开出红字发票，其中两联作为其减少销项税的原始凭证，另两联交给客户。
第三 仍然用贷项凭证的功能，只是通过配置，让系统自动生成如下会计分录： 借：产品销售收入 借：应交税金-增值税-销项 贷：应收帐款-客户明细 ，金额为折扣金额。同时手工开具红字发票，金额为原发票金额。再手工根据折扣后金额重开发票。将红字发票和重开发票同时作为贷项凭证的原始凭证。
需要注意的是ERP中在很多情况下使用贷项凭证，贷项凭证是直接以后续的调整金额记帐的。但是我国增值税管理要求对于增值税发票变更的处理，一般都是先用红字发票冲销，随后在对变更后的金额开具发票。所以在实施中要么仍然使用贷项凭证的方法，只是手工开红字发票和重开发票，并将两者一起作为贷项凭证的原始凭证，如本节中的第三种方案和下一节中的第二种方案。要么在ERP流程中也使用这种先冲销，再重开的方式，如本节中的第二种方案和下一节中的第三种方案。不过这两种方案都避免不了红字发票难开的问题，这已经不是ERP系统的问题，在实务中企业也会考虑其他的避免方法，比如本节第一种方案和下一节中第一种方案，以避免开红字发票。